Die Abfälle sollten trocken gehalten und eine direkte Sonneneinstrahlung vermieden werden. Für die Abfallbehälter bietet sich daher ein schattiger Stellplatz an, denn so werden Gärungsprozesse verhindert. 

Nach Möglichkeit sollte ein Behälter mit Deckel verwendet und dieser nach jeder Befüllung schnell geschlossen werden. 

Zudem sollten nur trockene Abfälle entsorgt werden. Es empfiehlt sich, diese vor der Entsorgung abtropfen zu lassen. Alternativ können feuchte Abfälle in Zeitungs- oder Küchenpapier eingewickelt werden. Das gilt auch für bereits verdorbene oder verarbeitete/gekochte Lebensmittel. Durch Zwischenschichten aus Eierkartons kann zusätzlich überschüssige Feuchtigkeit aufgenommen werden. 

Die Abfälle sollten nach Möglichkeit locker in dem Behälter liegen. Hier helfen beispielsweise Zwischenschichten aus Zweigen und Ästen. So wird der Abfallbehälter besser belüftet. 

Die Biotonne sollte nach der Leerung gereinigt werden. Für die Reinigung ist Wasser ausreichend. Wichtig ist, dass die Tonne vor der nächsten Benutzung richtig abtrocknet. 

Zudem kann der Boden der Abfallbehälter mit Zeitungspapier ausgelegt werden, damit die Abfälle nicht langfristig auf dem Tonnenboden kleben. Das Papier fängt Feuchtigkeit auf und bindet Gerüche. Auch eine regelmäßige Leerung trägt zu der Vermeidung von Gerüchen und Insektenbefall bei. 

Um Madenbefall zu vermeiden oder einzudämmen, können der Deckel- und der Tonnenrand sowie die Wände der Tonne mit Essigwasser ausgewaschen werden.